Fråga:
Varför var det så svårt att avkoda majsgenomet?
Gabriel Fair
2011-12-24 11:52:25 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Mina lärare som växte upp sa till mig att det var omöjligt att avkoda majsgenomet. Men ändå är det gjort.

Varför var avkodningen av genomet så betydelsefull, och vad gjorde det så svårt?

Om jag minns rätt: det är enormt och har många repetitiva regioner. Det är väldigt svårt att exakt sekvensupprepa * de novo * med hög trohet.
Två svar:
#1
+23
Damian Kao
2011-12-24 12:48:36 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Det korta svaret är att majsgenomet är stort och har en enorm mängd dubbleringshändelser. Cirka 80% av genomet upprepas. Det är svårt att montera genom med stora mängder duplikationer, eftersom vår sekvenseringsteknologi i praktiken i bästa fall kan ge ~ 500 baspar. Att räkna ut ordningen för duplicerade regioner är beroende av ställningssekvenser eller jämförande sammansättning med risgenomet.

#2
+9
chkuo
2012-01-06 00:13:34 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Varför var avkodning av genomet så betydelsefullt? Eftersom avkodning av genomet ger oss en fullständig bild av en organisms genetiska sammansättning.

Vad gjorde det så svårt ? De repetitiva sekvenser som andra personer nämner är ett huvudproblem. Imaging du försöker slutföra ett stort pussel med miljontals bitar. Varje bit representerar en sekvensbestämning som vi får från experimentet. Om det finns upprepade sekvenser i genomet, skulle i princip de bitar som representerar dessa regioner se väldigt lika ut (eller till och med helt identiska). Utan tvekan skulle detta göra pusslet mycket svårt att avsluta. För att ge en skala är majsgenomet ~ 2,3 miljarder baspar och varje sekvensbestämning är <1000 baspar.



Denna fråga och svar översattes automatiskt från det engelska språket.Det ursprungliga innehållet finns tillgängligt på stackexchange, vilket vi tackar för cc by-sa 3.0-licensen som det distribueras under.
Loading...