Fråga:
Kan siRNA inducera DNA-metylering i däggdjursceller?
Mad Scientist
2011-12-16 15:00:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

För några år sedan publicerade Hiroaki Kawasaki och Kazunari Taira en artikel som heter "Induktion av DNA-metylering och genavstängning genom kort interfererande RNA i mänskliga celler" i Nature:

I växter kan dsRNAs riktade mot CpG-öar inom en promotor också inducera RNA-riktad DNA-metylering 3, 4, 5, 6, 7, 8 ; emellertid förblir det oklart huruvida gendämpning medierad av DNA-metylering kan induceras av dsRNA i däggdjursceller. Här visar vi att kort interfererande RNA (siRNA; 21-25-nukleotid-RNA-molekyler) inducerar DNA-metylering och histon-H3-metylering i humana celler.

Detta papper tycktes visa att siRNA också kan inducera långvarig tystnad av gener genom DNA-metylering i däggdjursceller, vilket inte tidigare har observerats. Tyvärr drogs tidningen tillbaka senare, vilket ifrågasatte resultaten.

Jag tyckte tidningen var väldigt spännande då, eftersom den föreslog möjligheten att utföra genterapi, att tysta specficic gener, bara genom att använda RNA-interferens.

Vad är det nuvarande vetenskapliga samförståndet här, finns det några övertygande bevis för att siRNA-inducerad DNA-metylering är möjlig i däggdjursceller? Kunde någon replikera resultaten från Kawasaki och Taira?

Ett svar:
#1
+15
Rik Smith-Unna
2012-02-01 06:05:33 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Från en kort litteraturöversikt verkar det som om Kawasaki och Taira till stor del har bekräftats av samhället före och sedan deras tidning. Återkallandet skedde endast av Taira, Kawasaki vägrade att underteckna eftersom han hävdade att uppgifterna var giltiga. Från retraktionen verkar det som att anledningen till retraktionen var en förlorad labbok.

Före Kawasaki och Taiga-papperet fanns det redan flera andra artiklar som beskriver RNAi-inducerad epigenetisk modifiering hos däggdjur:

Sedan fanns ytterligare ett papper nästa år av Kawasaki & Taira, som inte drogs tillbaka:

Och det verkar som att idén nu är allmänt accepterad och stöds av en hel del andra studier, främst tittar på könsceller . Till exempel:

Det finns ingen recension som jag kunde hitta som verkligen binder allt övertygande, men det finns flera recensioner på RNAi riktad histon- och kromatinmodifiering i allmänhet som nämner att faktum nu är fastställt hos däggdjur:

Kimcellreferensen (Carmell et al., 2007) beskriver inte siRNA, utan handlar om helt annan klass av små RNA, kallad piRNA (i papperet kallade de dem rasiRNA, men piRNA är nu en vanligt förekommande nomenklatur) . Det finns avgörande skillnader mellan siRNA och piRNA (storleksfördelningar och proteiner som de associerar med) och de bör inte blandas.
Jag bläddrade igenom Joshua-Tor och Hannon (2010) recension som du citerade och jag har inte märkt något omnämnande av siRNA som styr DNA-metylering (eller histonmodifiering) hos däggdjur. Ledsen om jag missade det, kan du snälla citera relevant mening?
@Sergei du har rätt! Det papperet nämner faktiskt piRNA-riktad metylering, snarare än siRNA. Jag lämnar det i svaret eftersom det fortfarande är relevant för frågan.


Denna fråga och svar översattes automatiskt från det engelska språket.Det ursprungliga innehållet finns tillgängligt på stackexchange, vilket vi tackar för cc by-sa 3.0-licensen som det distribueras under.
Loading...