Fråga:
Hamiltons inkluderande träningsmetod
falsum
2015-01-08 21:56:20 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Den underliggande intuitionen med Hamiltons modell för inkluderande kondition är att vi ska studera socialt beteende ur aktörers synvinkel - snarare än mottagarna. För att bygga sin modell uttrycker Hamilton genotypen för skådespelaren $ j $ i termer av genotypen för mottagaren av beteendet, $ i $. Genotypen på $ j $ sönderdelas i två delar, '' gener som kopieras genom direkt replikering av gener i $ i $; den andra delen består av icke-replikgener '' (Hamilton 1970, s. 1219). Hamilton (1970) definierar vidare $ q_ {i} $ som genfrekvensen för replikadelen, $ b_ {ij} $ representerar replikfraktionen, och $ q $ är den genomsnittliga genfrekvensen i populationen. Från dessa definitioner hoppar Hamilton (1970) till jämställdheten: \ begin {ekvation} E (q_ {j}) = \ frac {1} {1-b_ {i}} \ vänster \ {(b_ {ij} - b_ { i}) q_ {i} + (1-b_ {ij}) q \ höger \} \ slut {ekvation} där \ börjar {align *} b_ {i} = \ frac {1} {n} \ sum_ {j } b_ {ij} \ end {align *}

Hur härledde Hamilton ovanstående ekvation?


Här är vad I tror Hamilton gör. Mitt intryck är att ovanstående ekvation uttrycker $ E (q_j | q_i) $ som en linjär regression på $ q_i $. Med andra ord tror jag att ovanstående ekvation motsvarar:

$ E (q_j | q_i) = E (q_j) + \ beta (q_i - E (q_i)) $

$ E (q_j | q_i) = q + \ beta (q_i - q) $

Faktum är att ekvationen är ekvivalent med Hamiltons ekvation om regressionskoefficienten är:

$ \ beta = (b_ {ij} - b_i) / (1 - b_i) $

Jag har dock inte kunnat härleda denna regressionskoefficient. Med tanke på att $ \ beta = Cov (q_j, q_i) / Var (q_i) $, misstänker jag att vägen att gå är att skriva om $ q_j $ och $ q_i $ i termer av $ b_ {ij} $ och $ b_i $ och beräkna regressionskoefficienten.


Referens:

Hamilton 1970 "Självisk och ondskapsfullt beteende i en evolutionär modell" http: // www.nature.com/nature/journal/v228/n5277/abs/2281218a0.html


Excerpt from Hamilton's paper

Hamiltons tidningar är alltid så komplicerade!
Kommit överens! Jag tror att hans papper från 1964 är ännu värre. Jag antar att ovanstående ekvation är en linjär regression av $ q_j $ på $ q_i $. Men jag förstår fortfarande inte hur Hamilton kom till ekvationen ovan.
Tråkigt att se att forskningsnivå ofta inte får lika mycket uppmärksamhet som grundläggande frågor. Jag hoppas att du får fler röster och får någon mindre lat än jag som är redo att dyka in i Hamiltons artikel.
Jag kan inte komma åt papperet så kan du ge mer information om modellen. Dessutom, $ E (q_j | q_i) $ villkorligt förväntat värde?
@dustin: Hamilton använder inte villkorliga sannolikheter. Jag är den som skrev på det sättet när jag förklarade min fråga. Jag ändrade detta nu.
@dustin: Jag lade också till den relevanta delen av hans uppsats. Vad Hamilton gör tidigare är att uttrycka konditionen ur mottagarens synvinkel. Detta beskrivs här: http://biology.stackexchange.com/questions/26396/hamiltons-derivation-of-direct-fitness-from-his-1970-paper
Två svar:
dustin
2015-01-20 22:08:22 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Från den begränsade informationen kan jag ge följande men jag är inte säker på om det är det du letar efter. Dessutom ser jag fortfarande inte uttalandet där författaren drar slutsatsen att vi får linjär regressionsmodell $ E (q_i) = Aq_i + C $ vilket är udda notation eftersom det säger att det förväntade värdet är en linjär regression. I själva verket, om det är en linjär regression, ska det säga $ q_j = Aq_i + C $. $$ A = \ frac {\ text {cov} (q_i, q_j)} {\ text {var} (q_i)} \ quad \ text {och} \ quad C = E [q_j] - \ frac {\ text {cov} (q_i, q_j)} {\ text {var} (q_i)} E [q_i]. $$ Nu kan vi skriv variansen och kovariansen som \ begin {align} \ text {var} (q_i) & = E [q_i ^ 2] -E ^ 2 [q_i] \\\ text {cov} (q_i, q_j) & = E [ q_iq_j] -E [q_i] E [q_j] \ end {align} där det förväntade värdet för en diskret slumpmässig variabel $ X $ beräknas som $$ E [X] = \ sum_ {i = 1} ^ Nx_ip_X [x_i] $$ där $ p_X [x_i] $ är sannolikheten för $ x_i $ och $ N $ kan räknas oändligt.


Medelvärdet av villkorliga PDF-filer kommer upp i optimal förutsägelse där det minsta genomsnittliga kvadratfelet är $ E_ {Y \ mid X} [Y \ mid x] $. Denna optimala förutsägelse täcker linjär och icke-linjär. För den vanliga Gaussiska PDF-filen kommer den optimala förutsägelsen att vara linjär eftersom $ E_ {Y \ mid X} [Y \ mid x] = \ rho x $ där $ \ rho $ är korrelationskoefficienten. Jag ska korta hand $ E_ {Y \ mid X} [Y \ mid x] $ to $ E [Y \ mid x] $$$ E [Y \ mid x] = \ mu_Y + \ frac {\ rho \ sigma_Y} {\ sigma_X} (x- \ mu_X) $$ där $ \ mu_i $ $ i = X, Y $ är medelvärdet och $ \ sigma_i $ är standardavvikelsen. Om $ X $ och $ Y $ inte är gaussiska, kan modellen vara olinjär. Finns det exempel på icke-Gaussiska vara linjärt förmodligen.

Du har rätt. Hamilton säger inte att denna ekvation är en linjär regression. Detta antog jag (jag ändrade min fråga för att spegla det). Min gissning är att Hamiltons ovanstående ekvation uttrycker $ E (q_j \ mid q_i) = E (q_j) + \ beta (q_i - E (q_i)) $, där $ \ beta $ är regressionskoefficienten.
@falsum vad menar du med $ E [q_j \ mid q_i] $. Jag vet att det har ett villkorat förväntat värde. Är det vad du menar?
Ja. Det är detta jag menar. * Min gissning * är att Hamilton tillhandahåller en ekvation som försöker förutsäga genfrekvensen för en slumpmässig skådespelare (dvs $ q_j $) från en given $ q_i $.
@falsum Om vi ​​använder den definitionen finns det en chans att det kommer att vara en icke-linjär prediktor som inte är linjär.
Ant
2015-04-15 05:28:26 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Det är inte en regression (inte i detta skede av tidningen, en regression kommer att göras senare)

Det enda komplicerade att förstå är $ b_i $, som är "basrelateringen", dvs hur $ i $ är relaterat till en slumpmässig individ (som kan jämföras med hur relaterad det är till individer som det interagerar med).

För att förenkla låt oss först överväga situationen där $ b_i = 0 $:

$ E (qj) = b_ {i, j} q_i + (1-b_ {i, j }) q $ är bara översättningen av 'genfrekvensen för replikdelen är q_i' och 'genfrekvensen för den icke-replika delen är $ q $'; eftersom $ b_ {i, j} $ är bråkdelen av replikdelen, dvs chansen att vårt intresseområde tillhör replikdelen av enskilda $ i $ i enskilda $ j $.

Nu ska vi återinför $ b_i $. Tanken är att jämföra släktförhållandet mellan de två individerna $ i $ och $ j $ med den genomsnittliga släktförhållandet mellan $ i $ och en slumpmässigt vald person i befolkningen (denna slumpmässiga släkt är exakt $ bi $). Detta är viktigt eftersom $ q $ redan står för denna 'slumpmässiga släkt'.

Så istället för att ge sannolikheten $ b_ {i, j} $ till $ q_i $, ger vi sannolikheten $ b_ {i, j} -b_i $, vilket är chansen att allelen av intresse är närvarande på grund av att replikfraktionen är högre än slumpmässig. Och för att kvantiteten nu varierar mellan 0 och $ 1-b_i $ normaliserar vi den med $ 1-b_i $

Den underliggande intuitionen i Hamiltons modell för inkluderande kondition är att vi bör studera socialt beteende från punkten syn på aktörer - snarare än mottagare

Inte exakt, det säger att vi ska studera socialt beteende ur de alleler som orsakar det, som kan delas mellan skådespelare och mottagare. Men det här dokumentet är inte det papper som introducerar inkluderande kondition , snarare tvärtom, det är papperet som försöker förena familjeval med prisekvationen.

du säger att $ (b_ {i, j} -b_i) \ i [0,1-b_i] $. Mitt intryck är att $ (b_ {i, j} -b_i) \ i [-b_i, 1-b_i] $. $ (b_ {i, j} -b_i) $ är negativ när den enskilda $ j $ är mindre relaterad till enskilda $ i $ än genomsnittet.
Jag antar att den nedre gränsen för $ \ frac {(b_ {ij} - b_ {i})} {(1-b_ {i})} $ är $ - \ frac {b_ {i}} {(1-b_ { i})} $ (sedan $ 0 \ leq b_ {ij} \ leq 1 $). Detta verkar emellertid inte rätt eftersom annars kan $ \ frac {(b_ {ij} - b_ {i})} {(1-b_ {i})} $ anta värden i intervallet $ [0, - \ infty) $.


Denna fråga och svar översattes automatiskt från det engelska språket.Det ursprungliga innehållet finns tillgängligt på stackexchange, vilket vi tackar för cc by-sa 3.0-licensen som det distribueras under.
Loading...