För att se till att jag inte jämför äpplen och päron kommer mitt (försök) att svara på frågan delas upp i två delar: jämförelse av enkelsträngade nukleinsyror och dubbelsträngade.
Enkel strandat DNA och RNA
Både DNA och RNA kan bilda enkelsträngade komplexa tertiära strukturer där sekundära strukturelement är associerade genom van der Waals-kontakter och vätebindningar. Närvaron av en 2'-hydroxylgrupp gör att ribosring föredrar olika konformationer än deoxiribos i DNA. Eftersom 2'-OH-delen både är vätedonator och acceptor, ger den RNA större flexibilitet för att bilda 3D-komplexa strukturer och stabilitet för att förbli i en av dessa konformationer . Som Aleadam märker visar detta papper att tRNA och dess DNA-analog bildar liknande tertiära strukturer även om tDNA inte är så stabilt som tRNA:
Därför hävdar vi att den globala konformation av nukleinsyror dikteras främst av interaktionen mellan purin- och pyrimidinbaser med atomer och funktionella grupper som är gemensamma för både RNA och DNA. I denna åsikt är 2-hydroxylgruppen, åtminstone i tRNA, ett extra strukturellt särdrag vars roll är begränsad till att främja lokala interaktioner, vilket ökar stabiliteten för en given konformation.
Dessa författare visar också att åtminstone en slinga i tDNA-analogen är mer mottaglig för klyvning genom en restriktionsendonukleas. I denna region har tRNA en vattenmolekyl väte bunden till 2'hydroxylgrupp.
Jag kunde inte hitta fler av sådana intressanta jämförelser i litteraturen.
Dubbelsträngat DNA och RNA
Både DNA och RNA kan bilda dubbelsträngade strukturer. Återigen bestämmer sockerkonformationen formen på spiralen: för DNA-spiralen är det vanligtvis B-form, medan spiralformat RNA bildar A-geometri under nästan alla förhållanden. I RNA-helix finner vi ribosen huvudsakligen i C3'-endo -konformationen, eftersom 2'-OH steriskt missgynnar C2'-endo-konformationen, nödvändig för B-formgeometri.
Fysiologisk betydelse
dsRNA och ssDNA ger ofta en signal till cellen att något är fel. dsRNA ses naturligtvis i normala processer som RNA-interferens men det kan också stoppa proteinsyntes och signalera virusinfektioner (se dubbelsträngade RNA-virus). På samma sätt är ssDNA mycket mer benägen för nedbrytning än dsDNA, det signalerar ofta DNA-skada eller infektioner från enkelsträngade DNA-virus och inducerar celldöd. Därför är DNA 3D-strukturen, under normala förhållanden, mestadels en dubbelsträngad helix, medan RNA har en enkelsträngad, "proteinliknande", komplex 3D-struktur.